تشخیص مولکولی بیماریهای عفونی
برخی از میکروبها از جمله باکتریها، قارچها، انگلها و ویروسها باعث ایجاد عفونت در انسان میشوند. این موارد به عنوان عوامل عفونی یا پاتوژن شناخته میشوند. تکنیکهای سنتی برای تشخیص این عوامل بیماریزا شامل اقداماتی است از جمله: کشت و رشد دادن میکروبها در محیط کشت به دنبال آن شناسایی میکروب و آزمایش نمونه خون برای یافتن آنتی بادیهایی که سیستم ایمنی در پاسخ به عفونت تولید میکند.
از آنجا که میکروب ها حاوی مواد ژنتیکی هستند (DNA و RNA) و با ماده ژنتیکی موجود در سلولهای انسان متفاوت است؛ میتوان از نمونههایی مثل: خون، خلط ، مدفوع، ادرار ، مایع مغزی نخاعی، مایع آمیونیتیک، بثورات پوستی، بزاق و… جهت تستهای ژنتیکی برای تشخیص عفونت به صورت مستقیم یا در مواردی پس از کشت میکروب استفاده کرد. مهمترین ویژگی تستهای تشخیص مولکولی نسبت به سایر روشها حساسیت، اختصاصیت، دقت و سرعت بالاتر در جوابدهی است.
یکی از بهترین روشهای مولکولی مورد استفاده برای بررسی کمی وکیفی پاتوژن ها تکنیک Real time PCR است. در این تکنیک علاوه بر اختصاصیت و دقت بالا، امکان تعیین تعداد(Quantity) پاتوژنها از جمله ویروس هپاتیت سی (HCV)، ویروس هپاتیت ب (HBV) وسیتومگالوویروس (CMV) وجود دارد. همچنین حساسیت بالای این تکنیک در تشخیص گونه میکروارگانیسم ها (typing) در موارد زیادی مانند تعیین ژنوتیپ ویروسهای هرپس سیمپلکس (HSV) ، هپاتیت سی (HCV) و ویروس پاپیلومای انسانی (HPV) مورد استفاده قرار میگیرد.
تعیین مقاومت دارویی عوامل عفونی از دیگر ویژگیهای تکنیکReal time PCR است که میتواند روند درمان بیماری را تحت تاثیر قرار دهد. به طور مثال سویههای مقاوم به دارو پاتوژن مایکوباکتریوم توبرکلوزیس (MDR-TB) که عامل اصلی ایجاد بیماری سل است؛ را میتوان با بررسی ژنهای مربوط به مقاومت آنتی بیوتیکی، در کوتاهترین زمان ممکن (کمتر از یک روز) با کمک تکنیک Real time PCR شناسایی کرد.
در آزمایشگاه ژنتیک “بنیان” تستهای تشخیص مولکولی بیماریهای عفونی ذیل برای مراجعین محترم در دسترس میباشد:
- HPV Genotyping باروش Real time PCR
- بررسی کمی وکیفی HBV باروش Real time PCR
- بررسی کمی و کیفی HCV با روش Real time PCR
- بررسی کمی و کیفی HIV با روش Real time PCR
- بررسی کمی و کیفی HSV با روش Real time PCR
- بررسی کمی و کیفی BK/JC با روش Real time PCR
- بررسی کمی و کیفی CMV با روش Real time PCR
- بررسی کمی و کیفی Mycobacterium Tuberculosis با روش Real time PCR
- بررسی کیفی Epstein –Barr Virus (EBV) با روش Real time PCR
- بررسی کیفی Varicella-Zoster Virus( VZV) با روش Real time PCR
- بررسی کیفی Mycoplasma pneumonia با روش Real time PCR